2006年底，完成新館內容建設方案大綱，確定了常設展覽“創(chuàng)新·和諧”的主題，規(guī)劃了“科學樂園”、“華夏之光”、“探索與發(fā)現(xiàn)”、“科技與生活”、“挑戰(zhàn)與未來”五個主題展廳以及公共空間科普展示。2007年5月至6月期間，內容建設方案向社會公布，開通熱線電話、網上專欄和論壇等形式向社會各界廣泛征求意見和建議，并舉辦了常設展覽展區(qū)創(chuàng)意競賽，共有22家國內外公司參與，征集創(chuàng)意方案共計64個。9月完成了新館常設展覽方案的設計工作，并由國內專家委員會審議通過。經過一年多的緊張制作，2009年4月，各展區(qū)布展公司進入新館，開始布展施工。6月，展品陸續(xù)進場進行安裝調試。